Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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