Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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