Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms