Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms