Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRG4Q92954 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms