Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms