Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLGN4YQ8NFZ3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms