Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms