Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms