Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms