Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms