Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms