Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms