Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms