Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms