Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms