Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms