Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms