Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms