Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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