Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms