Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN1Q14699 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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