Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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