Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms