Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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