Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMC2Q13753 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms