Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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