Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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