Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms