Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG1Q06432 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms