Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CD164Q04900 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms