Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RPL23AP7-201ENST00000391616 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 HNRNPH3P1-201ENST00000431935 583 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC095050.1-201ENST00000502661 905 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms