Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms