Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP1P63208 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKP1P63208 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms