Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms