Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP107P57740 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP107P57740 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP107P57740 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP107P57740 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP107P57740 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP107P57740 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms