Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms