Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms