Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms