Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETV1P50549 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETV1P50549 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms