Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNTAP49354 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTAP49354 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms