Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ME1P48163 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ME1P48163 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ME1P48163 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ME1P48163 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ME1P48163 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ME1P48163 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ME1P48163 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ME1P48163 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ME1P48163 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ME1P48163 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ME1P48163 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms