Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIA4P48058 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms