Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms