Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASRP41180 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASRP41180 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASRP41180 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASRP41180 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASRP41180 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASRP41180 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASRP41180 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASRP41180 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASRP41180 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASRP41180 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASRP41180 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASRP41180 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASRP41180 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms