Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms