Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2IP36954 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms