Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA2P29317 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms