Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCAP28676 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCAP28676 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms