Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA1P25391 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms